據醫院官網2015年12月信息顯示，醫院設置165個臨床、醫技科室，233個護理單元，擁有8個國家重點學科、1個國家重點實驗室、20個省部級及全軍重點實驗室、33個全軍醫學專科中心和研究所，形成了以綜合診療為特色的13項專業優勢。同時是全軍重癥監護示范基地和中華護理學會的培訓基地。設有國際醫學中心和健康醫學中心，提供高端預防保健服務。醫院年門急診量490余萬人，收容19.8萬人，手術近9萬例。
學術專長：
擅長病毒性肝炎、艾滋病和疑難危重肝病的臨床診治工作，并結合臨床難題開展研究。
主要研究方向與課題：
系統地揭示了乙型肝炎臨床免疫學特征及肝臟損傷機制；提出了優化慢性乙肝抗病毒與免疫應答恢復的“爬坡假說”；闡明了艾滋病免疫重建失敗的關鍵機制；開拓了疑難肝病和艾滋病細胞與研究的新方向。
國家耳鼻咽喉疾病臨床醫學研究中心是為加強我國耳鼻咽喉疾病醫學科技創新體系建設、打造臨床醫學和轉化研究的“高地”而創建的項目，目標是形成我國耳鼻咽喉疾病重大臨床醫學研究的“國家隊”。
擬通過開展高質量循證醫學研究、驗證新技術和新方法、實施多學科交叉轉化研究、開發和推廣基層適宜技術、探索臨床研究方法和管理模式，搭建國家耳鼻咽喉疾病臨床研究公共技術支撐的平臺。通過高質量臨床多中心研究，出指南、出理論、出技術、出產品、出成效，為國家制定政策提供依據，以提高耳鼻咽喉疾病防控能力，改善民眾健康。
解放軍總醫院第二醫學中心老年醫學科是國家老年疾病臨床醫學研究中心老年醫學臨床研究基地及全國老年慢性病醫聯體牽頭單位。科室目前有正高職稱人員3名，副高職稱人員5名，形成覆蓋老年心血管、呼吸、消化、腫瘤、神經內科等各亞專業的老年多學科團隊。老年醫學科以老年綜合評估為核心技術，以全人全程管理為核心理念，強調多學科協作診療，利用可穿戴設備、5G等現代技術，形成集老年急性病救治、慢病管理、功能維護為一體的現代老年病管理模式，致力于構建高水平老年醫學規培基地、專培基地、保健人才培訓基地；新技術、新業務轉化平臺及老年病前沿基礎研究平臺，目前已有10余家協同網絡單位派駐醫護人員到該病房進修學習。科室圍繞建立全國老年隊列研究人群，構建高齡圍手術期風險管控、老年多病共患綜合管理等常見臨床問題的防控技術體系，及衰老機制及規律等開展臨床科研研究，作為項目牽頭單位承擔國家重點研發計劃、國家自然科學基金等多項國家、軍隊級課題，總項目經費達1.2億元。
