草魚魚苗在養殖過程中容易受到多種疾病的侵襲，做好疾病防治工作至關重要。常見的疾病有爛鰓病、腸炎病和赤皮病等。爛鰓病主要由感染引起，患病魚苗的鰓絲腐爛、粘液增多，嚴重時會導致呼吸困難。防治方法是定期用二氧化氯等劑對池塘進行，保持水質清潔；一旦發現病魚，可用恩諾沙星等拌餌投喂。腸炎病多由投喂變質飼料或水質惡化引起，魚苗會出現腹部膨大、肛門、腸道充血等癥狀。預防腸炎病要保證飼料新鮮，定期投喂大蒜素等免疫增強劑；時可使用氟苯尼考等。赤皮病通常因魚體受傷后感染所致，病魚體表充血、鱗片脫落。防治措施包括在拉網、運輸等操作時避免魚體受傷，發病后用聚維酮碘溶液全池潑灑。此外，還可定期在飼料中添加維生素 C、維生素 E 等，增強魚苗的。